在食品制作和成品存放中，通常采用高溫干燥、燙、巴氏滅菌，冷凍以及電離輻射等常規技術來實現對食品的殺蟲滅菌與保鮮。但這些設備大都龐大，處理時間長，滅菌不徹底或不易實現自動化生產。同時往往影響食品的原有風味和營養成分。而微波殺蟲滅菌是使食品中的蟲菌等微生物，同時受到微波熱效應與非熱效應的共同作用，使其體內蛋白質和生理活動發生變異，而導致微生物體生長發育延緩和死亡，達到食品殺蟲、殺菌、保鮮的目的。
 
    眾所周知，細菌、成蟲與任何生物細胞一樣是由水、蛋白質、核酸、碳水化合物、脂肪和無機物等復雜化合物構成的一種凝聚態介質。其中水是生物細胞的主要成分，含量在75～85%，因為細菌的各種生理活動都必須有水參與才能進行，而細菌的生長繁殖過程，對各種營養的吸收是通過細胞膜質的擴散、滲透吸附作用來完成的。
 
    在一定強度微波場的作用下，食品中的蟲類和菌體也會因分子極化馳豫同時吸收微波能升溫。由于它們是凝聚態介質，分子間強作用力加劇了微波能向熱能的能態轉化。從而使體內蛋白質同時受到無極性熱運動和極性轉動兩個方面的作用，使其空間結構變化或破壞而使其蛋白質變性。蛋白質變性后，其溶解度、粘度、膨脹性、滲透性、穩定性都會發生明顯變化，而失去生物活性。這**是微波熱效應殺蟲滅菌的機理。