用于各種粉狀物料的烘干、殺菌處理，如：雜糧粉殺菌、米粉、芝麻粉、調味品、添加劑、雞粉、辣椒粉、蛋白粉、米面粉、豆粉、淀粉、果蔬粉、營養保健品等物料。

微波液體滅菌機主要用于口服液、糖漿等液體藥劑以及保健茶等的滅菌保鮮；還可用于白酒、醋等的催陳老熟。物料與微波作用過程為全封閉式，具有滅菌速度快、效率高、溫度低、催陳效果明顯、操作簡便、易于控制、無接觸污染等優點。液體物料由管道輸送系統輸送至加熱器中，液體在微波能的作用下升溫，液體物料中的細菌則被微波電磁場作用下的生產效應和熱效應殺滅

  微波殺菌設備是利用了電磁場的熱效應和生物效應的共同作用的結果。微波對細菌的熱效應是使蛋白質變化，使細菌失去營養，繁殖和生存的條件而死亡。微波對細菌的生物效應是微波電場改變細胞膜斷面的電位分布，影響細胞膜周圍電子和離子濃度，從而改變細胞膜的通透性能，細菌因此營養不良，不能正常新陳代謝，細胞結構功能紊亂，生長發育受到抑制而死亡。此外，微波能使細菌正常生長和穩定遺傳繁殖，是由若干氫鍵松弛，斷裂和重組，從而誘發遺傳基因突變，或染色體畸變甚至斷裂。